Изменение метилирования группы апоптоз-ассоциированных белок-кодирующих генов и генов длинных некодирующих РНК как фактор в нарушении их экспрессии при раке молочной железы

Алена Дмитриевна Селезнева; Светлана Сергеевна Лукина; Анна Дмитриевна Селезнева; Ирина Валерьевна Пронина; Дина Мироновна Меркулова; Татьяна Павловна Казубская; Алексей Михайлович  Бурдённый; Элеонора Александровна Брага; Виталий Игоревич Логинов

doi:10.25557/0031-2991.2024.04.4-13

Изменение метилирования группы апоптоз-ассоциированных белок-кодирующих генов и генов длинных некодирующих РНК как фактор в нарушении их экспрессии при раке молочной железы

Авторы

Алена Дмитриевна Селезнева ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии», 125315, Москва, Россия, Балтийская ул., д. 8; https://orcid.org/0009-0001-5472-8879
Светлана Сергеевна Лукина ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии», 125315, Москва, Россия, Балтийская ул., д. 8 https://orcid.org/0000-0001-6246-2444
Анна Дмитриевна Селезнева ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии», 125315, Москва, Россия, Балтийская ул., д. 8; https://orcid.org/0009-0000-0741-3965
Ирина Валерьевна Пронина ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии», 125315, Москва, Россия, Балтийская ул., д. 8; ФГАОУ ВО «Государственный университет просвещения», 141014, Московская область, Мытищи, Россия, ул. Веры Волошиной, д. 24 https://orcid.org/0000-0002-0423-7801
Дина Мироновна Меркулова ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им . И.М . Сеченова» Минздрава России (Сеченовский Университет), 119991, Москва, Трубецкая ул., д . 8, Россия
Татьяна Павловна Казубская ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России, 115478, Москва, Россия, Каширское шоссе, д. 23; https://orcid.org/0000-0001-5856-0017
Алексей Михайлович Бурдённый ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии», 125315, Москва, Россия, Балтийская ул., д. 8;ФГБУН «Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля» РАН, 119334, Москва, Россия, ул. Косыгина, д. 4 https://orcid.org/0000-0002-9398-8075
Элеонора Александровна Брага ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии», 125315, Москва, Россия, Балтийская ул., д. 8; ФГБНУ Медико-генетический научный центр им. академика Н.П. Бочкова, 115522, Москва, Россия, ул. Москворечье, д. 1 https://orcid.org/0000-0001-5188-4094
Виталий Игоревич Логинов ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии», 125315, Москва, Россия, Балтийская ул., д. 8; ФГБНУ Медико-генетический научный центр им. академика Н.П. Бочкова, 115522, Москва, Россия, ул. Москворечье, д. 1 https://orcid.org/0000-0003-2668-8096

DOI:

https://doi.org/10.25557/0031-2991.2024.04.4-13

Ключевые слова:

метилирование ДНК, апоптоз-ассоциированные белок-кодирующие гены, длинные некодирующие РНК, рак молочной железы

Аннотация

Предпосылки и цели. Настоящее исследование было направлено на изучение роли изменений уровня метилирования ДНК и экспрессии мРНК белок-кодирующих генов внутренней системы апоптоза APAF1, BAX и BIM и генов длинных некодирующих РНК (днРНК) ADAMTS9-AS2 и HAND2-AS1 в возникновении и прогрессии рака молочной железы (РМЖ), а также проведение анализа кометилирования и коэкспрессии представителей этих двух групп генов. Методика. Анализ уровня метилирования проводился методом количественной метил-специфичной ПЦР в реальном времени на выборке из 47 парных (опухоль/прилежащая гистологически нормальная ткань молочной железы) образцов РМЖ. Для оценки уровня экспрессии проводили реакцию обратной транскрипции с последующей амплификацией кДНК с помощью SYBR Green ПЦР в реальном времени. Для оценки значимости различий между исследуемыми группами применяли непараметрический критерий Манна–Уитни для независимых выборок. Различия считали значимыми при р≤0.05. Результаты. Показано статистически значимое увеличение уровня метилирования всех исследуемых генов и статистически значимое снижение уровня экспрессии генов APAF1 и ADAMTS9-AS2 в опухолевой ткани молочной железы. Выявлены статистически значимые ассоциации уровня метилирования генов BAX, APAF1, HAND2-AS1 и ADAMTS9-AS2 со стадией, гена HAND2-AS1 – с размером опухоли, гена BIM – с наличием метастазов в лимфатических узлах. Также продемонстрирована связь между изменением уровня экспрессии генов BIM и APAF1 и показателями прогрессии РМЖ (стадией и размером опухоли). Показана статистически значимая отрицательная корреляция между изменением статуса метилирования промоторных CpG-островков генов APAF1, BAX и ADAMTS9-AS2 и изменением уровня их экспрессии. Обнаружено ко-метилирование генов: ADAMTS9-AS2 – BIM/APAF1/BAX и HAND2-AS1 – BAX и ко-экспрессия генов ADAMTS9-AS2 – BAX. Заключение. Полученные данные могут быть использованы для обоснования применения исследуемых в работе генов в качестве маркеров для диагностики и прогноза РМЖ.

Загрузки

Опубликован

2024-12-26

Выпуск

Том 68 № 4 (2024)

Раздел

Оригинальные исследования

Как цитировать

[1]

2024. Изменение метилирования группы апоптоз-ассоциированных белок-кодирующих генов и генов длинных некодирующих РНК как фактор в нарушении их экспрессии при раке молочной железы. Патологическая физиология и экспериментальная терапия. 68, 4 (Dec. 2024), 4–13. DOI:https://doi.org/10.25557/0031-2991.2024.04.4-13.